Hairpin loop

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Um exemplo de uma estrutura em gancho (hairpin loop ou stem-loop) do ARN.

Um hairpin loop (em português: estrutura em grampo) ou stem-loop (em português: ansa pedunculada) é uma estrutura que pode ocorrer em ADN de cadeia simples. Nesta estrutura ocorre o emparelhamento de pares de base intramoleculares.[1] Ocorre quando duas regiões da mesma molécula, normalmente formando um palíndromo, formam pares de bases para constituírem uma dupla hélice que termina em um laço não emparelhado. Os hairpin loops variam em comprimento de 7 a 20 pb.[2] A estrutura resultante é um bloco de construção de muitas estruturas secundárias de ARN. A terminação intrínseca é um mecanismo em procariontes que faz com que a transcrição do RNA seja interrompida. Os terminadores intrínsecos incluem hairpin loops seguidos por uma série de resíduos U.[3]

Referências

  1. Ye, Yuzhen; Tang, Haixu. In: Mandoiu, Ion I.; Zelikovsky, Alexander. Bioinformatics Algorithms: Techniques and Applications. New Jersey: John Wiley & Sons, 2008. Capítulo: 2-Dynamic Programming Algorithms For Biological Sequence and Structure Comparison, p. 19-20.
  2. Krebs, Jocelyn E.; Goldstein, Elliot S.; Kilpatrick, Stephen T.. Lewin's Genes X. Boston: Jones and Bartlett Publishers, 2011. p. 526. ISBN 978-0-7637-6632-0
  3. Krebs, Jocelyn E.; Goldstein, Elliot S.; Kilpatrick, Stephen T.. Lewin's Essential Genes. 2ª ed. Boston: Jones and Bartlett Publishers, 2010. p. 284-285. ISBN 978-0-7637-5915-5